材料與方法
LX-100 手掌型離心機(江蘇海林市其林貝爾儀器制造有限公司);2-16PK 型高速臺式離心機(SIG- MA 公司);PCR 儀(TaKaRa);YP202N 電子天平(上 海精密科學儀器有限公司);DYY-6C 型電泳儀(北京 市六一儀器廠);微波爐(青島海爾制品有限公司)電 泳槽(北京君意東方電泳設備有限公司);Hws24 電熱 恒溫水浴鍋 (上海一恒儀器有限公司)Gel Doc 2 000 紫外凝膠成像分析系統(tǒng)(美國 Bio-RAD)。Ex Taq DNA 聚合酶、Ex Taq Buffer、DNA Marker (2 000)、DNA 提取試劑盒 (TIANamp Genomic DNA Kit)、超凈水、引物、核酸電泳緩沖液(TAE)、6×Load- ing Buffer、瓊脂糖(AGAROSE G-10)、dNTP Mixture、 溴化乙錠(EB)。
結果
目前用于構建系統(tǒng)發(fā)育樹的基因,以線粒體 pcox1 和核糖體 ITS1、ITS2 基因應用最為廣泛。其 中,在使用 pcox1 基因作為分子標記時范圍沒有核糖 體 ITS1、ITS2 基因那么廣。pcox1 和 ITS 都擁有高度 的保守性,但 pcox1 基因的特點為種內分化弱,種間 分化強,而 rDNA 序列功能上具有進化時鐘性,目前 已經被應用到物種分類與進化分析中,尤其是種間 的分類。ITS 進化快,物種內發(fā)生變異的幾率小, 物種間發(fā)生變異的幾率大。通過分析 ITS 序列可以 構建進化樹并分析其親緣關系。但是實驗由于基因 庫中沒有片形褶皺絳蟲的 pcox1 基因,所以用 pcox1 作為目的基因只鑒定了該未知蟲體的屬,而無法確 定鑒定該絳蟲具體是什么,而基因庫中有片形褶皺 絳蟲 ITS 的序列,所以我們可以確切的證明未知絳蟲 為片形褶皺絳蟲。
免責聲明:文章僅供學習和交流,如涉及作品版權問題需要我方刪除,請聯(lián)系我們,我們會在第一時間進行處理。